تفاصيل الوثيقة

نوع الوثيقة : رسالة جامعية 
عنوان الوثيقة :
دراسة جينومية ومظاهر التنوع في طفيليات الأمعاء من جنس انتاميبا في منطقة مكة المكرمة
GENOMIC STUDIES AND DIVERSITY PROFILING OF INTESTINE ENTAMOEBA PARASITE IN MAKKAH REGION
 
الموضوع : كلية العلوم 
لغة الوثيقة : العربية 
المستخلص : يعتبر استخدام التكرارات القصيرة والمتتابعة (STR) داخل جين الحمض النووي الناقل (tRNA) في جينوم الانتاميبا من اكثر الطرق شيوعا في تعريف السلالات الخاصة بأنواع Entamoeba حتى الآن. في هذه الدراسة ، تم تطويرطريقة موثوق بها وسهلة وسريعة تعتمد على استخدام وسيلة جزيئية جديدة لتعريف الأنواع والسلالات. وقد تم عزل الحمض النووي من عينات البراز التي تم جمعها من المرضى المصابين في منطقة مكة المكرمة قي المملكة العربية السعودية. وتم تصميم نوعين من البواديء للمقارنة حيث أن الأولى تستهدف مناطق التكرارت القصيرة المتتابعةSTR سالفة الذكر ، في حين تم تصميم الثانية بعد عمل عدة مقارنات لعدة مناطق من الجينوم لنوعي الـ histolytica & dispar باستخدام برنامج نيوسمار(NUCmer) في المناطق المتناظرة بنسبة تشابه كبيرة )حوالي ٩٠٪( والاختلاف لا يتجاوز ~٩٠ قاعدة نيتروجينة. كما أن الطريقة الجزيئية المستخدمة تراعي أن يتم ارتباط البواديء المصممة في مناطق محددة ومتجانسة يتراوح حجمها بين ٢٠٠ -٥٠٠ نيوكليوتيده في الحمض النووي لجينوم كلا النوعين) انتاميبا هستوليتكا وانتاميبا ديسبر( باستثناء وجودindels - مناطق حذف أو اضافه( والتي ينتج عنها اختلاف حجم القطع الجينية داخل النوعين . وكشفت الدراسة أن الانماط التي تم الحصول عليها بالطريقة الأولى عن وجود العديد من التكرارت او القطع الجينية المختلفة مما يجعلنا نتوقع أنه من الممكن أن البواديء قد ارتبطت بمناطق غير مستهدفة على جينوم الإنتاميبا ولا نستبعد أن تكون قد ارتبطت مع انواع اخرى غير الأنتاميبا تتواجد داخل عينات البراز. والنتائج لا تلغي استخدام الطريقة الأولى ماعدا في كونها اخفقت في تحديد الاصابة المزدوجة بالنوعين. عموماً فإن الطريقة الجديدة في هذا البحث قد تكون مفيدة على مستوى تعريف النوع بينما نجد أن استخدام الطريقة الأولى جيدة لتعريف السلالات. علاوة على ذلك ، أشارت نتائج الفطريات إلى أن تنوع العينات قد تغير قليلاً بسبب وجود الطقيل . كما أشارت شجرة القرابة dendrogram التي توضع العلاقات إلى أن أكثر أنواع الشعب التقسيمية شيوعًا في الأمعاء البشرية هي Ascomycota , Basidiomycota و الZygomycota استنادًا إلى وفرة الأنواع التابعة لها ، كما تم العثور على الأنواع Pichia kudriavzevii و Candida glabrata و Saccharomyces cerevisiae من فئة Ascomycota بينما Rhodotorula mucilaginosa تتبع شعبة Basidiomycota. كما أدى التحليل القائم على مسافات التنوع أحادي الكتلة unifrac diversity)) إلى الفصل التام بين المجموعتين المصابة والغير مصابة (الكونترول).ايضا أشارت نتائج الوفرة التفاضلية إلى أن عددًا من أربعة شعب و 6 عائلات وتسعة أجناس وعشرة أنواع أظهرت تغيرات كبيرة في انواع الفطريات المتواجدة داخل الأمعاء داخل الأفراد المصابة وفيما بينها. بشكل عام، أظهرت الأنواع غير المصنفة من جنس Malassezia من عائلة Basidiomycota وفرة عالية في الأفراد المصابة مقارنة مع الأفرادةالأصحاء ، في حين أن العائلات Saccharomycetaceae من جنس Saccharomyces ونوع S. cerevisiae أظهرت نتائج عكسية. أشار حجم تأثير التحليل الخطي التمييز (or LDA) (LEFSE) إلى أن عائلة الساكروميسيتاسيا ، والتي يعتبر الساكروميسيس سيريزيسيا من الأنواع المندرجة منها، أنه من الممكن أن تكون علامة بيولوجية داخل الأفراد الأصحاء ويمكن اعتبارها علامة بيولوجية سلبية للإصابة بداء الأميبات. في الختام ، تقدم الدراسة طريقة جديدة يمكن أن تكون مفيدة على مستوى تمييز الأنواع ، في حين أن نهج STR المرتبط بالحمض النووي الريبوسومي الناقل يمكن أن يكون اختيارًا جيدًا على مستوى السلالات. كما توفر الدراسة رؤى جديدة حول الاستخدام المحتمل للسكرومايسيس كبروبيوتيك ضد داء الأميبات. 
المشرف : أ.د. احمد بهي الدين محمد 
نوع الرسالة : رسالة دكتوراه 
سنة النشر : 1441 هـ
2020 م 
المشرف المشارك : أ.د. جمال صابر محمد صابر 
تاريخ الاضافة على الموقع : Sunday, March 15, 2020 

الباحثون

اسم الباحث (عربي)اسم الباحث (انجليزي)نوع الباحثالمرتبة العلميةالبريد الالكتروني
داليا عبداللطيف ابوالجدايلAbuljadayel, Dalia Abdulatifباحثدكتوراه 

الملفات

اسم الملفالنوعالوصف
 46082.pdf pdf 

الرجوع إلى صفحة الأبحاث